Микробиологическая диагностика дисбактериоза кишечника

Информация об исследовании

Исследование кала на дисбактериоз проводится микробиологическим методом. Используется для оценки состояния микрофлоры кишечника, выявления причины диареи.

Исследование кала на дисбактериоз кишечника позволяет оценить состав микрофлоры и выявить в нем отклонения, а также разработать индивидуальный план терапии.

Дисбактериоз — это изменение качественного и количественного состава микробиоценоза кишечника. К этому состоянию могут приводить разные причины:

  • изменение характера питания;

  • воспалительные процессы;

  • длительная антибиотикотерапия;

  • хирургическое лечение;

  • длительный стресс;

  • иммунодефицит;

  • проживание в нехарактерной климатической зоне (высокогорье, Арктика).

Нормальные бактерии ЖКТ:

  • бифидобактерии;

  • лактобактерии;

  • типичные формы кишечной палочки;

  • энтерококки;

  • бактероиды (анаэробы).

Кроме «полезных» бактерий, в кишечнике существует условно-патогенная флора. Эти микроорганизмы в норме могут присутствовать в биотопе, но увеличение их количества влечет за собой изменение соотношения микроорганизмов в биоценозе прямой кишки и может приводить к клиническим проявлениям дисбактериоза. К таким микроорганизмам относятся:

  • неферментирующие бактерии;

  • грибки;

  • энтеробактерии;

  • клостридии;

  • стафилококки.

В норме не обнаруживаются, но при заболеваниях встречаются патогенные бактерии. В их число входят:

  • патогенные эшерихии;

  • шигеллы;

  • сальмонеллы.

Исследование позволяет определить характер изменений микрофлоры кишечника и выявить патологию, которая привела к ее развитию.

Показания к назначению исследования

  • Диарея.

  • Атопический дерматит, хроническая диарея, поражения кишечника из-за действия ионизирующей радиации или химических веществ.

  • Длительный период восстановления после кишечных инфекций.

  • Длительно протекающие кишечные расстройства, при которых не удается выделить патогенные микроорганизмы.

  • Дисфункция кишечника у пациентов, подвергавшихся длительному воздействию радиации, химических веществ и т. п., интенсивной антибиотико- и/или иммунодепрессивной, химио- и гормональной терапии.

  • Наличие бактериемии, гнойно-воспалительных очагов, трудно поддающихся лечению (пиелиты, холециститы, язвенный колит, энтероколит, вялотекущие пневмонии).

  • Проведенное хирургическое лечение при наличии факторов риска развития дисбактериоза кишечника.


Противопоказания и ограничения
Абсолютных противопоказаний нет.

Факторы, влияющие на результат исследования:

  • прием лекарственных средств с антимикробной активностью;

  • прием препаратов, изменяющих перистальтику кишечника и цвет кала.

Подготовка к исследованию

  • За 14 дней до анализа необходимо прекратить прием антибиотиков.

  • За 72 часа до исследования — отказаться от использования ректальных свечей и масел, слабительных средств и клизм, приема препаратов, оказывающих влияние на работу кишечника и окраску кала.

  • Биоматериал не должен содержать примеси мочи и воды. Нельзя собирать кал с памперсов, из горшков, медицинского судна, унитаза.

Материал для исследования

Кал.

Метод исследования

Микробиологический метод.

Референсные значения (нормы)

  • Микрофлора Результат Bifidobacterium (бифидобактерии): 10*9–10*10
  • Lactobacillus (лактобактерии): 10*7–10*8
  • E.coli (кишечная палочка с нормальной ферментативной активностью): 10*7–10*8
  • E.coli (кишечная палочка со сниженной ферментативной активностью): <10*5
  • E.coli (лактозонегативная кишечная палочка): </=10*5
  • E.coli (гемолизирующая кишечная палочка): 0
  • Enterococcus (энтерококки): 10*5-10*8
  • Микробы рода Proteus (протей): </=10*4
  • Klebsiella (клебсиелла): </=10*4
  • Enterobacteriaceae (энтеробактерии): Hafnia (гафния), Serratia (серрация), Citrobacter (цитробактер) и другие: </=10*4
  • Еnterobacter (энтеробактер): </=10*4
  • Staphylococcus aureus (стафилококк золотистый): 0
  • Staphylococcus epidermidis (стафилококк эпидермальный): </=10*4
  • Грибы рода Candida (кандида) и другие дрожжевые грибы: </=10*4
  • Неферментирующие грамотрицательные бактерии: </=10*4

Интерпретация результата

Анализ на дисбактериоз кишечника показывает:

  • повышение количества условно-патогенных бактерий на фоне нормального числа бифидобактерий;

  • рост титра условно-патогенной флоры с падением концентрации бифидобактерий до 107–108 КОЕ/г;

  • уменьшение числа лакто- и бифидобактерий без повышения концентрации условно-патогенных бактерий или сапрофитов;

  • снижение количества бифидобактерий с одновременным массовым уменьшением числа лактобацилл, появлением кишечной палочки атипичной формы, обнаружением высоких титров условно-патогенной флоры (до 107–108
    КОЕ/г).

Диагноз «дисбактериоз кишечника» основывается на результатах клинического обследования пациента и данных микробиологического исследования кала.

Следует учитывать динамическое изменение микробиоценоза толстого кишечника в зависимости от многих параметров состояния организма, в том числе и от состава пищи. Биоматериал одного пациента, полученный в разное время, не всегда будет идентичен по составу и количеству выделенных микроорганизмов.

Использованная литература

  1. Методические рекомендации «Бактериологическая диагностика дисбактериоза кишечника», утв. Минздравом РСФСР — 1977.
  2. Отраслевой стандарт «Протокол ведения больных дисбактериозом кишечника». ОСТ 91500.11.0004-2003.
  3. Определение дисбиотических изменений желудочно-кишечного тракта по маркѐрам содержимого кишечника. Федеральные клинические рекомендации — 2005.
  4. Клинические рекомендации национальной ассоциации специалистов по контролю инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи и общероссийской общественной некоммерческой организации «ассоциации колопроктологов России» по диагностике, лечению и профилактике Clostridium difficile-ассоциированной диареи (CDI) — 2017.
  5. Chan BK, Abedon ST, Loc-Carrillo C. Phage cocktails and the future of phage therapy. Future Microbiol. 2013 Jun;8(6):769-83.
  6. Robles Alonso V, Guarner F. Linking the gut microbiota to human health. Br J Nutr. 2013 Jan;109 Suppl 2:S21-6. Review.
Читайте также:  Как вылечить дисбактериоз кишечника народные

Источник

В отечественной практике диагностика и микробиология неотделимы друг от друга. Анализ кала даёт представление о составе флоры в толстой кишке. На этом диагностика дисбактериоза обычно заканчивается. Мамы собирают кал у грудничка, доктор ставит диагноз, составляется диета, подбираются смеси. Всякий, ощутивший зуд в заднем проходе, может попробовать аналогичный алгоритм действий. Однако, дисбактериоз оказывает тотальное влияние не только на ЖКТ. Алопеция, себорея порой служат симптомами либо являются прямым следствием дисбактериоза.

Не всякий образованный человек понимает, что причины избранных болезней берут начало в ЖКТ. Тяжёлый дисбактериоз служит причиной рака, прочих заболеваний, исключение – СПИД. В западных школах медицины на протяжении десятков лет утверждают, что диагностика одной толстой кишки не имеет практического смысла. Это состояние воспринимается следствием прочих заболеваний. В РФ доказали, что дисбактериоз у кормящей мамы ведёт к немедленному пополнению списка больных новорождёнными младенцами (на третьи сутки максимум).

Микрофлора

Установлено, что совокупная численность микробов (500 видов) в человеке достигает десяти в 14 степени, что на порядок больше, нежели количество клеток, составляющих организм. Подавляющая часть флоры обитает в кишечнике, общим весом 1-2 кг. Традиционный бактериологический анализ затрагивает 10-15 видов из массы. Реальная картина происходящего в кишечнике отличается от результата анализа.

Типичные признаки, сопровождающие заболевание, к примеру, стафилококковый дисбактериоз кишечника, чётко описаны. Многие заболевания недостаточно изучены. Метеоризм при дисбактериозе наблюдается у большого количества пациентов. Но выделение газов происходит регулярно, человек на любой стадии развития постоянно выделяет водород и метан. Диагностика показывает – штаммы, не являющиеся частью нормальной микрофлоры, провоцируют обширное газообразование, сравнительно с нормой. Механизм вздутия слабо изучен, штаммы, его вызывающие, не определены до настоящего времени.

Получается, человек, исследуя океан и Луну, не знает многого о собственном теле. Не всякая мать сможет объяснить необходимость прикладывания ребенка к груди уже через 2 часа после родов. Таким образом происходит переход к формированию нормальной микрофлоры кишечника новорождённого.

Микрофлора кишечника

Не удивительно, что диагностика находится на низком уровне. При анализе необходимо учитывать разницу показателей у детей до года и детей старшего возраста. Игнорирование информации приведёт к неправильному диагнозу. Полное формирование микрофлоры заканчивается в 2 года.

Причин нарушению баланса изучено немало. К примеру, приём антибиотиков после операции. Лишь каждый десятый признан абсолютно здоровым в подобных условиях.

Методики исследования

Постоянно появляются новые методики исследования. К примеру, в 2001 году Hopkins предложил использовать молекулярно-генетический способ гибридизации 16 SrPHK. С высокой точностью определяются виды (что важно), но трудоёмкость и сложность подбора реактивов затрудняют исследования. Молекулярный метод основан на выявлении участков ДНК взаимодействующих видов при помощи электрофореза (либо отличающимся способом).

Метод ГХ-МС имеет немало общего с названным, ориентируется на ряд жирных кислот, производство которых тесно связано со структурой ДНК. Набор ЖК аналогичен «отпечаткам пальцев» исследуемой бактерии. Удаётся подобным образом идентифицировать несколько тысяч штаммов, в организме видов культур около 500. В последнее десятилетие серийно выпускается оборудование в указанной области. Остаётся составить карту наличия жирных кислот в продуктах жизнедеятельности определённых бактерий.

Читайте также:  Дисбактериоз кишечника после алкоголя

Сегодня ГХ-МС позволяет получить информацию о сотнях видов. Гораздо больше, чем любая методика. Точное определение возбудителей важно для выбора лечения. В результате выявляются патологии: выпадение волос, лишний вес, дерматиты, жжение в заднем проходе. Распознается набор штаммов, влияющий на развитие патологических состояний. В подобных случаях важна точная диагностика, для недопущения развития заболевания.

Исследование фагочувствтительности

Данные о фагочувствительности при помощи ГХ-МС заполучить чрезвычайно сложно. Сбор показаний зависит от чувствительности оборудования. В обычных условиях культура проращивается, уничтожается определённым образом (к примеру, при помощи грибов). Исследование включает улавливание специфичных веществ, служащих результатом успешной борьбы, позволяет составить прогноз заболевания, предоставляет информацию, эффективен ли воздействующий фактор.

Бактериологический анализ

Из горла берут мазок при выявлении заболеваний дыхательной системы, кровь сдают для оценки биохимических показателей, напрямую показывающих, здоров человек либо болен. Диагностика при дисбактериозе кишечника основывается на исследовании кала. По-другому проверить, что творится в недрах ЖКТ, затруднительно. На западе посев на питательные среды считают методом ненадёжным по перечисленным причинам.

Сложно выдержать идеальные условия

Правильный способ диагностического забора кала.

  1. Нужна герметичная стеклянная посуда, иначе воздух убьёт анаэробные бактерии (облигатная часть флоры).
  2. Маленькая посуда – воздух под крышкой уничтожит бифидобактерии и лактобациллы.
  3. Немедленно после сбора кала в количестве минимум 1 грамма следует плотно закупорить сосуд.
  4. Хранить анализ следует при температуре +4 градуса в течение четырёх часов. Получается, для выполнения условия банка должна оказаться на столике в лаборатории немедленно.

На западе трезво оценивают возможности лаборантов. Известно: открытие пенициллина произошло благодаря подобному нарушению. Александр Флеминг не выдержал идеальные условия выращивания опасного стафилококка. Вместе со штаммом на питательной среде поселился пенициллин.

Результат неточен

Забор кала предоставляет информацию о микрофлоре определённой части толстой кишки. Желательно анализу подвергать мукозную часть флоры, не полостную, как часто происходит в случае исследования фекалий. Непосредственно в слизистой происходят процессы формирования витаминов, всасывание микроэлементов. Кроме прочего, бактерии в экскрементах преимущественно мертвы.

По указанным причинам традиционный посев фекалий не является лучшим методом.

Суть метода

Суть заключается в посеве экскрементов на питательную среду. Бактерий множество, для каждого вида среда индивидуальна. По скорости роста штамма делаются выводы о начальной численности, оперируя таблицами норм. Сверяясь с данными, выставляется диагноз (отклонения популяции в меньшую либо большую сторону).

В заключение производится анализ обнаруженной условно-патогенной флоры на чувствительность к антибиотикам, назначается эффективный курс лечения. В комплексе, подобными мероприятиями ограничивается бактериологическая диагностика дисбактериоза кишечника.

ГХ-МС

Газовая хроматография в сочетании с масс-спектрометрией предоставляет преимущество в диагностировании, занимающее до 5 часов. Происходит в десятки раз быстрее, нежели выращивать экскременты. Методика не ищет живые бактерии, нацелена на обнаружение метаболитов микрофлоры, упрощающего процесс сбора анализов. Удешевляется сама операция, поскольку необходимость закупать дорогостоящую (преимущественно, патогенную) микрофлору отсутствует. Сложность резко снижается.

Врачи давно полагали, что существуют следы жизнедеятельности микроорганизмов, выбрасываемые в окружающую среду. Избыточный удельный вес результатов в испражнениях говорит о развитии определённого состояния. Результат интересен: в экскрементах присутствует полостная флора, и полный спектр метаболитов! Следовательно, живущие внутри организма виды бактерий (и грибов) определятся по следам метаболизма.

Рассказывая о гибели группы Дятлова, Ракитин говорил: по набору изотопов можно немало узнать о рабочем веществе реактора. Аналогия наблюдается в случае с микроорганизмами. Отходы жизнедеятельности сильно отличаются друг от друга, спутать затруднительно. Род определяется с точностью, определение вида допускает малую погрешность.

Георгий Осипов лестно отзывается о ГХ-МС. В первую очередь приводит доводы в пользу стоимости оборудования, упоминает о дешевизне расходных материалов. Не забывает про точность метода (до 2%). Завершающим доводом становится широкий спектр микроорганизмов, подверженных идентификации. Фактически, составляется полнейшая копрограмма, чрезвычайно сложная и затратная для получения традиционными методами.

Читайте также:  Лекарства для кишечника от дисбактериоза

Неотъемлемой частью методики является постоянство метаболитов. Доказано – за последние 2,5 млрд. лет процесс жизнедеятельности бактерий практически не менялся. Ошибочно полагать, что методика нова. Упоминания встречаются с 70-х годов XX века, первые серьёзные исследования проведены на базе РАМН в 90-е.

Суть метода

Проводится химическая реакция (к примеру, метанолиз) для выделения из пробы нужных компонентов. Превращение жирных кислот в метиловые эфиры лежит в основе анализа. Для указанного соблюдаются нужные условия, подготовка пробы занимает определённое время. Композиция эфиров представляет жидкость либо газ, вводимый в аппаратуру. Разделение производится на капиллярной колонке.

Получается гистограмма, где маркеры разделены расстоянием. Площади пиков интегрируются, выступая исходными данными дальнейших расчётов. Для любой молекулы сформированы признаки, используемые при идентификации. База данных покупается отдельно, исследование стоит денег. Возможности метода немало зависят от наличия информации. Недостаток веществ в базе данных делает невозможным идентификацию.

Спектр действия ГХ-МС крайне широк. Типичная база содержит признаки 1000 и более видов. Сообразно представленным данным, вычисляется плотность популяции штаммов.

ПЦР-диагностика

Лабораторная диагностика дисбактериоза не ограничивается двумя методиками. Потому что у врачей всегда должен быть выбор. Когда нет конкуренции, отсутствует и прогресс. Полимеразная цепная реакция работает с ДНК. Изобретена в 1983 году Кэри Мюллисом.

В заданных условиях происходит копирование имеющегося участка молекулы. Реакция проходит в пробирке под действием специальных ферментов. Зная последовательность нуклеотидов, легко предсказать результат. Постепенно открылись методы, минимизирующие число мутаций, результат анализа становится достоверным.

Длина копируемого участка ограничена, составляет 3000 звеньев. Для сравнения – геном человека кодируется при помощи 3 млрд. пар. В науке метод ПЦР часто используют для внесения намеренных мутаций в код ДНК. Это проверенный способ криминалистов вынести вердикт, сильно влияющий на решение суда. Сходство генов – надежное доказательство вины либо невиновности.

Какой анализ выбрать

У пациента клиники нет выбора. Сегодня диагностика проводится исключительно бактериологическая. На фоне дисбактериоза, осложнённого диареей, ожидание в течение 1 недели невыносимо. Как питаться больному ребёнку? Что делать взрослому?

Настоятельно рекомендуем внимательно собирать о симптомах нужную информацию. Если возникает аллергия из-за дисбактериоза, записывайте данные о местах возникновения дефектов. К примеру, аллергический вид крыльев носа указывает на дефицит витамина В. Покраснение в районе волосяной части головы – симптом себореи.

Как избежать

Диагностика по клиническим признакам сложновыполнима. Поможет информация о консистенции кала, цвете, запахе. Если грибковый дисбактериоз вызвал стоматит, немногие знают, с чего начинать лечение. Попутно с типичными в подобных случаях препаратами проводится диагностика баланса микрофлоры кишечника. Заодно оказывается помощь желудку.

На сайте представлена исчерпывающая информация по дисбактериозу, способная оказать весомую помощь. Полезно употреблять в пищу клетчатку, олигосахариды. Упоминалось о роли народных средств: пейте травы. Рост патогенной флоры подавляется при помощи ягод:

  • земляника, черноплодная рябина, черника, малина, чёрная смородина помогают в отношении сальмонелл и стафилококка;
  • абрикосы, клюква уничтожают микробы гниения;
  • голубика, брусника борются с Candida.

Включайте указанные продукты в рацион, практикуйте введение прикорма при дисбактериозе детям, формируя иммунитет. Детям младшего возраста дают отжатые соки. При лактазной недостаточ­ности сделайте акцент на бифидобактерии., растущие на молочном сахаре, играющие роль источника лактазы (либо заменителя). Покупайте ферменты отдельно, в аптеке.

Упорно продолжайте кормление грудью младенцев (не из бутылочки), правильным образом формируя внутреннюю микрофлору ребёнка. При запорах делайте акцент на продукты питания:

  1. Чёрный хлеб.
  2. Варенье.
  3. Мёд.
  4. Сироп.
  5. Овощи.
  6. Сахар.

Диарея устраняется известными народными средствами. Употребляют продукты с танином: заварка (запивается водой), сушёная черника, корки лимона и граната, горошины чёрного перца, столовая ложка крахмала. Полезно употреблять сыр, творог, добавлять кальций к ежедневному рациону.

Источник