Микробиологические исследования на дисбактериоз кишечника

Код 124.0.
Кал

Биоматериал для этого исследования принимается по сокращённому графику. Это связано с тем, что пробы должны попасть в лабораторию в очень короткий срок. Проверьте сокращённый график в вашем отделении.

Приём, исследование биоматериала
Показания к назначению
Описание

Приём и исследование биоматериала

Приём материала

Можно сдать в отделении Гемотест — 156 отделений
Можно сдать анализ дома

Метод исследования

Микробиологический

Когда нужно сдавать анализ Микробиологическая диагностика дисбактериоза кишечника?

Диарея.
Атопический дерматит, хроническая диарея, поражения кишечника из-за действия ионизирующей радиации или химических веществ.
Длительный период восстановления после кишечных инфекций.
Длительно протекающие кишечные расстройства, при которых не удается выделить патогенные микроорганизмы.
Дисфункция кишечника у пациентов, подвергавшихся длительному воздействию радиации, химических веществ и т. п., интенсивной антибиотико- и/или иммунодепрессивной, химио- и гормональной терапии.
Наличие бактериемии, гнойно-воспалительных очагов, трудно поддающихся лечению (пиелиты, холециститы, язвенный колит, энтероколит, вялотекущие пневмонии).
Проведенное хирургическое лечение при наличии факторов риска развития дисбактериоза кишечника.

Подробное описание исследования

Исследование кала на дисбактериоз проводится микробиологическим методом. Используется для оценки состояния микрофлоры кишечника, выявления причины диареи.

Исследование кала на дисбактериоз кишечника позволяет оценить состав микрофлоры и выявить в нем отклонения, а также разработать индивидуальный план терапии.

Дисбактериоз — это изменение качественного и количественного состава микробиоценоза кишечника. К этому состоянию могут приводить разные причины:

изменение характера питания;
воспалительные процессы;
длительная антибиотикотерапия;
хирургическое лечение;
длительный стресс;
иммунодефицит;
проживание в нехарактерной климатической зоне (высокогорье, Арктика).

Нормальные бактерии ЖКТ:

бифидобактерии;
лактобактерии;
типичные формы кишечной палочки;
энтерококки;
бактероиды (анаэробы).

Кроме «полезных» бактерий, в кишечнике существует условно-патогенная флора. Эти микроорганизмы в норме могут присутствовать в биотопе, но увеличение их количества влечет за собой изменение соотношения микроорганизмов в биоценозе прямой кишки и может приводить к клиническим проявлениям дисбактериоза. К таким микроорганизмам относятся:

неферментирующие бактерии;
грибки;
энтеробактерии;
клостридии;
стафилококки.

В норме не обнаруживаются, но при заболеваниях встречаются патогенные бактерии. В их число входят:

патогенные эшерихии;
шигеллы;
сальмонеллы.

Исследование позволяет определить характер изменений микрофлоры кишечника и выявить патологию, которая привела к ее развитию.

Что ещё назначают с этим исследованием?

Использованная литература

Методические рекомендации «Бактериологическая диагностика дисбактериоза кишечника», утв. Минздравом РСФСР — 1977.
Отраслевой стандарт «Протокол ведения больных дисбактериозом кишечника». ОСТ 91500.11.0004-2003.
Определение дисбиотических изменений желудочно-кишечного тракта по маркѐрам содержимого кишечника. Федеральные клинические рекомендации — 2005.
Клинические рекомендации национальной ассоциации специалистов по контролю инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи и общероссийской общественной некоммерческой организации «ассоциации колопроктологов России» по диагностике, лечению и профилактике Clostridium difficile-ассоциированной диареи (CDI) — 2017.
Chan BK, Abedon ST, Loc-Carrillo C. Phage cocktails and the future of phage therapy. Future Microbiol. 2013 Jun;8(6):769-83.
Robles Alonso V, Guarner F. Linking the gut microbiota to human health. Br J Nutr. 2013 Jan;109 Suppl 2:S21-6. Review.

Подготовка к исследованию
Противопоказания и ограничения

Подготовка к исследованию

За 14 дней до анализа необходимо прекратить прием антибиотиков.
За 72 часа до исследования — отказаться от использования ректальных свечей и масел, слабительных средств и клизм, приема препаратов, оказывающих влияние на работу кишечника и окраску кала.
Биоматериал не должен содержать примеси мочи и воды. Нельзя собирать кал с памперсов, из горшков, медицинского судна, унитаза.

Противопоказания и ограничения

Абсолютных противопоказаний нет.
Факторы, влияющие на результат исследования:

прием лекарственных средств с антимикробной активностью;
прием препаратов, изменяющих перистальтику кишечника и цвет кала.

Интерпретация результата
Референсные значения

Интерпретация результата

Анализ на дисбактериоз кишечника показывает:

повышение количества условно-патогенных бактерий на фоне нормального числа бифидобактерий;
рост титра условно-патогенной флоры с падением концентрации бифидобактерий до 107–108 КОЕ/г;
уменьшение числа лакто- и бифидобактерий без повышения концентрации условно-патогенных бактерий или сапрофитов;
снижение количества бифидобактерий с одновременным массовым уменьшением числа лактобацилл, появлением кишечной палочки атипичной формы, обнаружением высоких титров условно-патогенной флоры (до 107–108 КОЕ/г).

Диагноз «дисбактериоз кишечника» основывается на результатах клинического обследования пациента и данных микробиологического исследования кала.

Следует учитывать динамическое изменение микробиоценоза толстого кишечника в зависимости от многих параметров состояния организма, в том числе и от состава пищи. Биоматериал одного пациента, полученный в разное время, не всегда будет идентичен по составу и количеству выделенных микроорганизмов.

Референсные значения

Микрофлора Результат Bifidobacterium (бифидобактерии): 10*9–10*10
Lactobacillus (лактобактерии): 10*7–10*8
E.coli (кишечная палочка с нормальной ферментативной активностью): 10*7–10*8
E.coli (кишечная палочка со сниженной ферментативной активностью): <10*5
E.coli (лактозонегативная кишечная палочка): </=10*5
E.coli (гемолизирующая кишечная палочка): 0
Enterococcus (энтерококки): 10*5-10*8
Микробы рода Proteus (протей): </=10*4
Klebsiella (клебсиелла): </=10*4
Enterobacteriaceae (энтеробактерии): Hafnia (гафния), Serratia (серрация), Citrobacter (цитробактер) и другие: </=10*4
Еnterobacter (энтеробактер): </=10*4
Staphylococcus aureus (стафилококк золотистый): 0
Staphylococcus epidermidis (стафилококк эпидермальный): </=10*4
Грибы рода Candida (кандида) и другие дрожжевые грибы: </=10*4
Неферментирующие грамотрицательные бактерии: </=10*4

Источник

Биоматериал

Для данного исследования лаборатория принимает следующий биоматериал:

Кал

Подготовка к исследованию

Взятие материала проводится до начала антибактериальной терапии или не ранее, чем через 2 недели после ее окончания.

Правила взятия биоматериала

Кал после естественной дефекации собирается в контейнер с ложечкой и завинчивающейся крышкой в количестве 1/3 объема контейнера (1–2 ложечки).

Доставка в лабораторию в день взятия биоматериала и не позднее 12 часов с момента сбора кала пациентом.

Метод исследования

Культуральные исследования

В кишечнике здоровых людей может находиться более 500 различных видов микроорганизмов, составляющих кишечную микрофлору. Дисбактериоз – это нарушение нормальной микрофлоры кишечника. Основные клинические проявления дисбактериоза кишечника: нарушение общего состояния (интоксикация, обезвоживание); снижение массы тела; симптомы поражения слизистых оболочек желудочно-кишечного тракта; нарушения пищеварения в различных отделах желудочно-кишечного тракта.

Исследование позволяет оценить качественный и количественный состав микрофлоры исследуемого биоматериала и оценить чувствительность микроорганизмов к бактериофагам. Нормальная микрофлора человека представляет собой совокупность микроорганизмов. При развитии патологических процессов состав микроорганизмов изменяется в сторону увеличения условно-патогенных и/или появления патогенных возбудителей.

Идентификация микроорганизмов производится на высокоточном масс-спектрометре Microflex (Bruker). На следующем этапе лабораторного исследования выполняется определение чувствительности возбудителя к бактериофагам, что позволяет врачу назначить адекватную терапию.

Показания к исследованию:

Подозрение на нарушение микрофлоры кишечника;
Подбор антибактериальной терапии;
Оценка эффективности антибактериальной терапии.

При микробиологическом исследовании кала на дисбактериоз выдается количественная оценка всех выделенных микроорганизмов в единицах измерения КОЕ/грамм с указанием референсных значений для каждого микроорганизма и результатами оценки чувствительности к фагам.

Исследование на дисбактериоз кишечника с определением чувствительности к бактериофагам включает в себя определение следующих микроорганизмов:

Микроорганизмы
Бифидобактерии
Лактобактерии
Клостридии
Escherichia coli типичные
Escherichia coli лактозонегативные
Escherichia coli гемолитические
Условно-патогенные энтеробактерии:
Klebsiella spp.
Citrobacter spp.
Enterobacter spp.
Hafnia spp.
Serratia spp.
Proteus spp.
Morganella spp.
Providencia spp.
Raoultella spp.
Неферментирующие бактерии:
Pseudomonas spp.
Acinetobacter spp.
Другие неферментирующие бактерии
Патогенные микроорганизмы
Энтерококки
Стафилококк золотистый
Staphylococcus saprophyticus, Staphylococcus epidermidis
Дрожжеподобные грибы рода Candida

Интерпретация проводится врачом с учетом клинических проявлений.

Обращаем Ваше внимание на то, что интерпретация результатов исследований, установление диагноза, а также назначение лечения, в соответствии с Федеральным законом № 323-ФЗ «Об основах охраны здоровья граждан в Российской Федерации» от 21 ноября 2011 года, должны производиться врачом соответствующей специализации.

Источник

Код 124.0.
Кал

Приём, исследование биоматериала
Показания к назначению
Описание

Приём и исследование биоматериала

Приём материала

Можно сдать в отделении Гемотест — 1 отделение
Можно сдать анализ дома

Метод исследования

Микробиологический

Когда нужно сдавать анализ Микробиологическая диагностика дисбактериоза кишечника?

Диарея.
Атопический дерматит, хроническая диарея, поражения кишечника из-за действия ионизирующей радиации или химических веществ.
Длительный период восстановления после кишечных инфекций.
Длительно протекающие кишечные расстройства, при которых не удается выделить патогенные микроорганизмы.
Дисфункция кишечника у пациентов, подвергавшихся длительному воздействию радиации, химических веществ и т. п., интенсивной антибиотико- и/или иммунодепрессивной, химио- и гормональной терапии.
Наличие бактериемии, гнойно-воспалительных очагов, трудно поддающихся лечению (пиелиты, холециститы, язвенный колит, энтероколит, вялотекущие пневмонии).
Проведенное хирургическое лечение при наличии факторов риска развития дисбактериоза кишечника.

Подробное описание исследования

изменение характера питания;
воспалительные процессы;
длительная антибиотикотерапия;
хирургическое лечение;
длительный стресс;
иммунодефицит;
проживание в нехарактерной климатической зоне (высокогорье, Арктика).

Нормальные бактерии ЖКТ:

бифидобактерии;
лактобактерии;
типичные формы кишечной палочки;
энтерококки;
бактероиды (анаэробы).

неферментирующие бактерии;
грибки;
энтеробактерии;
клостридии;
стафилококки.

В норме не обнаруживаются, но при заболеваниях встречаются патогенные бактерии. В их число входят:

патогенные эшерихии;
шигеллы;
сальмонеллы.

Что ещё назначают с этим исследованием?

Использованная литература

Методические рекомендации «Бактериологическая диагностика дисбактериоза кишечника», утв. Минздравом РСФСР — 1977.
Отраслевой стандарт «Протокол ведения больных дисбактериозом кишечника». ОСТ 91500.11.0004-2003.
Определение дисбиотических изменений желудочно-кишечного тракта по маркѐрам содержимого кишечника. Федеральные клинические рекомендации — 2005.
Клинические рекомендации национальной ассоциации специалистов по контролю инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи и общероссийской общественной некоммерческой организации «ассоциации колопроктологов России» по диагностике, лечению и профилактике Clostridium difficile-ассоциированной диареи (CDI) — 2017.
Chan BK, Abedon ST, Loc-Carrillo C. Phage cocktails and the future of phage therapy. Future Microbiol. 2013 Jun;8(6):769-83.
Robles Alonso V, Guarner F. Linking the gut microbiota to human health. Br J Nutr. 2013 Jan;109 Suppl 2:S21-6. Review.

Подготовка к исследованию
Противопоказания и ограничения

Подготовка к исследованию

За 14 дней до анализа необходимо прекратить прием антибиотиков.
За 72 часа до исследования — отказаться от использования ректальных свечей и масел, слабительных средств и клизм, приема препаратов, оказывающих влияние на работу кишечника и окраску кала.
Биоматериал не должен содержать примеси мочи и воды. Нельзя собирать кал с памперсов, из горшков, медицинского судна, унитаза.

Противопоказания и ограничения

Абсолютных противопоказаний нет.
Факторы, влияющие на результат исследования:

прием лекарственных средств с антимикробной активностью;
прием препаратов, изменяющих перистальтику кишечника и цвет кала.

Интерпретация результата
Референсные значения

Интерпретация результата

Анализ на дисбактериоз кишечника показывает:

повышение количества условно-патогенных бактерий на фоне нормального числа бифидобактерий;
рост титра условно-патогенной флоры с падением концентрации бифидобактерий до 107–108 КОЕ/г;
уменьшение числа лакто- и бифидобактерий без повышения концентрации условно-патогенных бактерий или сапрофитов;
снижение количества бифидобактерий с одновременным массовым уменьшением числа лактобацилл, появлением кишечной палочки атипичной формы, обнаружением высоких титров условно-патогенной флоры (до 107–108 КОЕ/г).

Референсные значения

Микрофлора Результат Bifidobacterium (бифидобактерии): 10*9–10*10
Lactobacillus (лактобактерии): 10*7–10*8
E.coli (кишечная палочка с нормальной ферментативной активностью): 10*7–10*8
E.coli (кишечная палочка со сниженной ферментативной активностью): <10*5
E.coli (лактозонегативная кишечная палочка): </=10*5
E.coli (гемолизирующая кишечная палочка): 0
Enterococcus (энтерококки): 10*5-10*8
Микробы рода Proteus (протей): </=10*4
Klebsiella (клебсиелла): </=10*4
Enterobacteriaceae (энтеробактерии): Hafnia (гафния), Serratia (серрация), Citrobacter (цитробактер) и другие: </=10*4
Еnterobacter (энтеробактер): </=10*4
Staphylococcus aureus (стафилококк золотистый): 0
Staphylococcus epidermidis (стафилококк эпидермальный): </=10*4
Грибы рода Candida (кандида) и другие дрожжевые грибы: </=10*4
Неферментирующие грамотрицательные бактерии: </=10*4

Источник

[10-065]
Дисбактериоз кишечника

1550 руб.

Микробиологическое исследование, которое позволяет оценить состав микрофлоры кишечника – концентрацию и соотношение “полезных”, условно-патогенных и патогенных микроорганизмов в кале, определить специфическую активность основных пробиотиков в отношении выявленных микроорганизмов и их чувствительность к бактериофагам и антибиотикам. К нормальной микрофлоре кишечника (“полезные” бактерии) относятся лактобактерии, бифидобактерии, энтерококки, кишечные палочки (типичные), анаэробная флора (бактероиды). Условно-патогенная флора – это энтеробактерии, неферментирующие бактерии, стафилококки, анаэробные бактерии (клостридии), грибы. Патогенными микроорганизмами являются сальмонеллы, шигеллы, патогенные эшерихии. При выявлении патогенных и/или условно-патогенных микроорганизмов будет определена их чувствительность к антимикробным препаратам (антибиотикам и бактериофагам) и пробиотикам. При обнаружении микроорганизмов, составляющих нормальную микрофлору, чувствительность к антибиотикам и бактериофагам не определяется, т.к. не имеет диагностического значения.

Синонимы русские

Дисбиоз кишечника, определение пробиотиков-антагонистов.

Синонимы английские

Intestinal dysbiosis, antagonistic activity of probiotics and bacteriophage sensitivity test, Intestinal dysbacteriosis.

Метод исследования

Микробиологический метод.

Какой биоматериал можно использовать для исследования?

Кал.

Как правильно подготовиться к исследованию?

Исследование рекомендуется проводить до начала приема антибиотиков и других антибактериальных химиотерапевтических препаратов.
Исключить прием слабительных препаратов, введение ректальных свечей, масел, ограничить (по согласованию с врачом) прием медикаментов, влияющих на перистальтику кишечника (белладонна, пилокарпин и др.), и препаратов, влияющих на окраску кала (железо, висмут, сернокислый барий), в течение 72 часов до сбора кала.

Общая информация об исследовании

Дисбактериоз (дисбиоз) кишечника – это нарушение состава и количественного соотношения бактериальных и грибковых микроорганизмов желудочно-кишечного тракта. В норме слизистая оболочка ЖКТ является средой обитания так называемых комменсальных микроорганизмов, обеспечивающих целый ряд защитных функций в обмен на микронутриенты, используемые человеком. Большинство кишечных комменсалов относятся к родам Lactobacillus, Bifidobacterium и Bacteroides (облигатные бактерии), хотя состав и количество микроорганизмов сильно варьируются в зависимости от отдела ЖКТ. Так, желудок характеризуется наименьшей плотностью бактерий, среди которых преобладают Lactobacillus, Streptococcus и Helicobacter pylori. В тонкой кишке обнаруживается до 103-106 КОЕ/мл бактерий, преимущественно Streptococcus и Lactobacillus. Наибольшая плотность комменсальных микроорганизмов наблюдается в толстой кишке (108-109 КОЕ/мл), где преобладают Bacteroides, Clostridium, Fusobacterium и Bifidobacterium. Комменсальные микроорганизмы находятся в динамическом взаимодействии с кишечным эпителием и, таким образом, являются механическим препятствием для инвазии патогенов. Кроме того, они секретируют ряд противомикробных соединений (например, дефензины). Бактерии-комменсалы способны регулировать иммунный ответ слизистых оболочек кишечника и в некоторых случаях подавлять воспалительные, в том числе аллергические, реакции. Нарушение баланса микробиоты возникает в результате длительного или бесконтрольного лечения антибактериальными препаратами, при нарушении моторики ЖКТ (послеоперационный период, прием слабительных препаратов), мальабсорбции (хронический алкоголизм, хронический панкреатит) и при некоторых других состояниях. Дисбактериоз может приводить к развитию заболеваний ЖКТ и других органов. Так, в настоящее время получены данные о его роли в патогенезе болезни Крона, неспецифического язвенного колита и целиакии, а также синдрома хронической усталости и атопического дерматита.

Основным способом диагностики дисбактериоза является микробиологический метод, при котором производят качественную и количественную оценку облигатных, условно-патогенных и патогенных микроорганизмов в кале. На основании результатов исследования делают вывод о дефиците облигатных микроорганизмов или об избыточном росте условно-патогенных или патогенных бактерий. Микробиологическое исследование – это один из наиболее специфических и чувствительных методов исследования, применяемых при диагностике дисбактериоза. Следует, однако, помнить, что бактериологический состав кала (он используется в качестве биоматериала) несколько отличается от бактериологического состава слизистой оболочки кишки. Кроме того, результат теста может зависеть от многих других факторов, таких как недавнее употребление антибактериальных препаратов, продуктов, богатых пробиотиками, или слабительных средств.

С учетом растущей устойчивости условно-патогенных и патогенных микроорганизмов к антибактериальным препаратам все большую роль в терапии дисбактериоза играют альтернативные методы лечения с помощью пробиотиков. Пробиотики – это группа препаратов, содержащих бактерии-комменсалы, или дрожжевые грибы. Считается, что они защищают организм от избыточной условно-патогенной и патогенной микробиоты. Совокупность защитных свойств пробиотиков в отношении какого-либо микроорганизма называется антагонистической активностью и может быть определена с помощью микробиологического исследования. В ходе анализа оценивается антагонистическая активность основных используемых в гастроэнтерологической практике пробиотиков. Определение антагонистической активности пробиотиков проводят перед назначением указанных препаратов для лечения дисбактериоза. Оно может быть дополнено анализом на чувствительность выявленных микроорганизмов к антибиотикам и бактериофагам.

Результат анализа оценивают с учетом дополнительным лабораторных и инструментальных данных.

Для чего используется исследование?

Для диагностики и лечения дисбактериоза кишечника, контроля его лечения;
чтобы установить причины кишечных расстройств;
для подбора рациональной терапии антибиотиками.

Когда назначается исследование?

При обследовании пациента после длительного курса лечения антибактериальными препаратами;
при обследовании пациента с указанием на бесконтрольный прием антибактериальных препаратов и слабительных средств в анамнезе;
при выявлении устойчивости условно-патогенных и патогенных микроорганизмов к антибактериальным препаратам;
при обследовании пациента с хроническим панкреатитом, хроническим алкоголизмом и другими состояниями, сопровождающимися мальабсорбцией;
при хронической диарее;
после долгого лечения антибиотиками, глюкокортикостероидами, иммунодепрессантами, химиотерапевтическими препаратами;
при аллергических заболеваниях, которые плохо поддаются лечению (например, атопическом дерматите);
после воздействия химических веществ или ионизирующей радиации – если есть симптомы дисфункции кишечника;
при длительном периоде выздоровления после острых кишечных инфекций.

Что означают результаты?

Виды микроорганизмов	Возраст, годы
Виды микроорганизмов	Меньше 1	1-60	Старше 60
Бактероиды	107– 108	109- 1010	1010- 1011

О дисбактериозе кишечника свидетельствует:

увеличение количества одного или нескольких видов условно-патогенных микроорганизмов при нормальном количестве бифидобактерий в кишечнике,
увеличение одного или нескольких видов условно-патогенных микроорганизмов при умеренном снижении количества бифидобактерий (на 1-2 порядка – до 107-108 КОЕ/г),
снижение содержания представителей облигатной микрофлоры (бифидобактерий и/или лактобацилл) без увеличения количества сапрофитной или условно-патогенной микрофлоры кишечника,
умеренное или значительное (7 КОЕ/г) снижение количества бифидобактерий в сочетании с выраженным уменьшением количества лактобацилл, появлением изменённых форм кишечной палочки, выявлением одного или нескольких представителей условно-патогенных микроорганизмов в высоких титрах (до 107-108 КОЕ/г).

Что может влиять на результат?

Антибактериальная терапия или терапия пробиотиками.

Также рекомендуется

Копрограмма

Кто назначает исследование?

Врач общей практики, гастроэнтеролог, педиатр, инфекционист.

Литература

Chan BK, Abedon ST, Loc-Carrillo C. Phage cocktails and the future of phage therapy. Future Microbiol. 2013 Jun;8(6):769-83.
Hütt P, Shchepetova J, Lõivukene K, Kullisaar T, Mikelsaar M. Antagonistic activity of probiotic lactobacilli and bifidobacteria against entero- and uropathogens. J Appl Microbiol. 2006 Jun;100(6):1324-32.
Robles Alonso V, Guarner F. Linking the gut microbiota to human health. Br J Nutr. 2013 Jan;109 Suppl 2:S21-6. Review.
Hardy H, Harris J, Lyon E, Beal J, Foey AD. Probiotics, prebiotics and immunomodulation of gut mucosal defences: homeostasis and immunopathology. Nutrients. 2013 May 29;5(6):1869-912.

Источник