Микробиологический анализ на кишечную микрофлору

• Приём, исследование биоматериала
• Показания к назначению
• Описание

Приём и исследование биоматериала

Приём материала

• Можно сдать в отделении Гемотест

Метод исследования

Газовая хроматография масс-спектрометрия (ГХ-МС) микробных маркеров

Когда нужно сдавать анализ Анализ микробиоты по Осипову (биотоп “Тонкая кишка”)?

• Подозрение на наличие дисбиоза
• Комплексная диагностика заболеваний, сопровождающихся нарушением состава микрофлоры кишечника
• Диагностика нарушений кишечного микробиома на фоне приема антибиотиков

Подробное описание исследования

Микрофлора (другое название – микробиом) кишечника играет огромную роль в поддержании здоровья человека. Бактерии, входящие в ее состав, способствуют расщеплению пищи, влияют на метаболизм всего организма, регулируют иммунитет, синтезируют необходимые витамины. Многие из этих функций микрофлора осуществляет посредством выделения особых веществ – жирных кислот, которые затем попадают в кровоток.

Предположительный состав нормальной микрофлоры предложен учеными, но продолжаются активные исследования в этой области. Данный состав может различаться в некоторых пределах, а также изменяться в зависимости от питания, климатических условий, психического состояния человека.

Нарушение композиции кишечного микробиома из-за неправильного питания, приема антибиотиков и некоторых других лекарств, заболеваний желудочно-кишечного тракта негативно отражается на его функциональных способностях. Это приводит к нарушению обмена веществ, снижению иммунитета и другим проблемам со здоровьем.

Среди обитателей кишечника встречаются аэробы, то есть бактерии, способные жить и размножаться при наличии кислорода. Однако большинство микроорганизмов являются анаэробами и не выживают при доступе кислорода. Ввиду этого ранее широко применявшиеся методы посева на питательные среды образцов, полученных из кишечника, не дают полного представления о составе микробиома и, тем более, о его функциях.

Эти недостатки позволил устранить анализ микробиоты по Осипову. В основе исследования лежат такие методы, как масс-спектрометрия и газовая хроматография. Использование современных приборов позволяет с большой точностью определить содержание жирных кислот, которые выделяют микроорганизмы, и, посредством анализа данных оценить состав кишечного микробиома.

Преимущество метода состоит в выявлении широкого спектра обитателей кишечника, среди которых многие живут только в бескислородной среде (анаэробы). 

Анализ микробиоты по Осипову является удобным и универсальным методом выявления дисбиоза. Он может выполняться в том числе в рамках контроля изменений микрофлоры при лечении заболеваний кишечника.

Метод назван в честь профессора Г.А. Осипова, впервые предложившего его для изучения состава микробиома.

Особенности и преимущества методики

Газовый хроматограф с масс-спектрометрическим детектором, производитель Agilent Technologies (США)

Что ещё назначают с этим исследованием?

Использованная литература

1. М. М. Гуров, Т. А. Романова, В. П. Новикова, И. А. Авилова. Роль новых методов диагностики в оценке состояния кишечной микробиоты У детей с хроническим гастродуоденитом. Вестник Челябинского государственного университета. 2014. No 13 (342).
2. Chang Y, Chen Y, Zhou Q, et al. Short-chain fatty acids accompanying changes in the gut microbiome contribute to the development of hypertension in patients with preeclampsia. ClinSci (Lond). 2020
3. Aragonès G,  Aguilar C, Colom-Pellicer M. Circulating microbiota-derived metabolites: a “liquid biopsy? Intnternational Journal of Obesity. 2020

• Подготовка к исследованию
• Противопоказания и ограничения

Подготовка к исследованию

1. Кровь сдают утром натощак (после последнего приема пищи должно пройти как минимум 8 часов). Вечером накануне поужинайте легкой нежирной пищей. Между последним приемом пищи и сдачей крови можно пить немного негазированной воды.
2. За 2 часа до сдачи крови на анализ нельзя курить, пить кофе и чай, а также фруктовые соки. Допустимо употребление небольшого количества негазированной воды. 
3. В течение 24 часов до анализа крови нельзя употреблять алкоголь и лекарственные препараты (по согласованию с лечащим врачом). Также избегайте интенсивных физических нагрузок.
4. За 1 час до исследования избегайте психоэмоционального напряжения, физического напряжения, такого как быстрый подъем по лестнице, бег. Желательно прийти в отделение лаборатории заблаговременно и в течение 10-15 минут до сдачи крови спокойно посидеть.
5. Не сдавайте кровь сразу после физиотерапевтических процедур, массажа, инструментальных обследований, таких как УЗИ и рентген в течение 5-7 дней. Это может повлиять на показатели крови и исказить результаты исследования. 
6. Если вы контролируете лабораторные показатели в динамике, постарайтесь сдавать каждый анализ в одно и то же время при одинаковых условиях. 

Противопоказания и ограничения

Абсолютных противопоказаний нет

• Интерпретация результата
• Единица измерения

Интерпретация результата

Результаты исследования представлены в виде перечисления обнаруженных микроорганизмов с указанием тех из них, кто является нормальным обитателем кишечника или обнаруживается только при патологии. 
Интерпретация полученных результатов должна проводиться только врачом с учетом жалоб, осмотра, данных различных методов исследования. 

Единица измерения

Кл/г

• Приём, исследование биоматериала
• Показания к назначению
• Описание

Приём и исследование биоматериала

Приём материала

• Можно сдать в отделении Гемотест
• Можно сдать анализ дома

Когда нужно сдавать анализ Посев кала на микрофлору?

Для установления возбудителя кишечной инфекции.
Для дифференциальной диагностики (наряду с другими исследованиями) заболеваний, протекающих со сходными симптомами (диарея, воспалительные заболевания кишечника, колоректальный рак, болезни, сопровождающиеся нарушением всасывания).
Для того чтобы оценить эффективность проводимой антибактериальной терапии.

Подробное описание исследования

Условно-патогенная флора – это микроорганизмы, которые присутствуют у человека в умеренных количествах.
Однако при определенных условиях их количество увеличивается и превышает допустимую норму, что приводит к соответствующим заболеваниям.
К наиболее распространенным представителям условно-патогенной флоры кишечника относятся:

• золотистый стафилококк (S. aureus)
• клебсиеллы (Klebsiella), эшерихии (Escherichia)
• энтеробактер (Enterobacter)
• цитробактер (Citrobacter)
• ацинетобактер (Acinetobacter)
• протей (Proteus)
• клостридии (Clostridia)
• серрации (Serratia)
• псевдомонады (Pseudomonas)
• дрожжеподобные грибы (Candida и др.) и другие возбудители.

Эти микроорганизмы могут вызывать инфекционное поражение желудочно-кишечного тракта с развитием гастроэнтерита, энтерита и энтероколита.

Что ещё назначают с этим исследованием?

Другие названия этого исследования

Названия на русском языке

Посев кала на УПФ

• Подготовка к исследованию
• Противопоказания и ограничения

Подготовка к исследованию

Исследование рекомендуется проводить до начала приема антибиотиков и других антибактериальных химиотерапевтических препаратов.
Исключить прием слабительных препаратов, введение ректальных свечей, масел, ограничить прием медикаментов, влияющих на перистальтику кишечника и на окраску кала, в течение 72 часов до сбора кала. Кал собирается естественным путем.
Кал должен быть получен без применения клизм и слабительных средств.
Биоматериал собирается при условии самостоятельного опорожнения кишечника,
Биоматериал собирают с чистой и не впитывающей влагу поверхности (чистый пакет, клеёнка).
Допускается использование судна или горшка. Ёмкость хорошо промывают с мылом, многократно ополаскивают водой, а затем обдают кипятком и остужают.
Доставляют в лабораторию в специальном контейнере в течение 3-х часов после сбора.
Для исследования достаточно 1-2 чайных ложки.

Противопоказания и ограничения

Факторы, влияющие на результаты исследований

Предшествующая антибактериальная терапия или химиотерапия ведет к ложноотрицательному результату.

• Интерпретация результата
• Дополнительное обследование при отклонении от нормы

Интерпретация результата

Если в посеве наблюдается умеренный рост условно-патогенных микроорганизмов (не превышающий норму), то утверждать, что они вызвали кишечную инфекцию, нельзя.
Обильный рост условно-патогенных микроорганизмов (превышающий норму) свидетельствует о том, что они явились причиной развития инфекции.

Дополнительное обследование при отклонении от нормы

21.2. Копрограмма
19.52.1. Менингококк, гемофильная палочка, стрептококк (Neisseria meningitidis, haemophilus influenzae, streptococcus pneumoniae, ПЦР) плазма, кач.
21.7. Простейшие
21.5. Яйца гельминтов
20.14. Хеликобактер пилори IgG (кол)
19.52.2. Менингококк, гемофильная палочка, стрептококк (Neisseria meningitidis, haemophilus influenzae, streptococcus pneumoniae, ПЦР) соскоб, кач.

Биоматериал

Для данного исследования лаборатория принимает следующий биоматериал:

• Кал

Подготовка к исследованию

Взятие материала проводится до начала антибактериальной терапии или не ранее, чем через 2 недели после ее окончания.

Правила взятия биоматериала

Кал после естественной дефекации собирается в контейнер с ложечкой и завинчивающейся крышкой в количестве 1/3 объема контейнера (1–2 ложечки).

Доставка в лабораторию в день взятия биоматериала и не позднее 12 часов с момента сбора кала пациентом.

Метод исследования

• Культуральные исследования

В кишечнике здоровых людей может находиться более 500 различных видов микроорганизмов, составляющих кишечную микрофлору. Дисбактериоз – это нарушение нормальной микрофлоры кишечника. Основные клинические проявления дисбактериоза кишечника: нарушение общего состояния (интоксикация, обезвоживание); снижение массы тела; симптомы поражения слизистых оболочек желудочно-кишечного тракта; нарушения пищеварения в различных отделах желудочно-кишечного тракта.

Исследование позволяет оценить качественный и количественный состав микрофлоры исследуемого биоматериала и оценить чувствительность микроорганизмов к бактериофагам. Нормальная микрофлора человека представляет собой совокупность микроорганизмов. При развитии патологических процессов состав микроорганизмов изменяется в сторону увеличения условно-патогенных и/или появления патогенных возбудителей.

Идентификация микроорганизмов производится на высокоточном масс-спектрометре Microflex (Bruker). На следующем этапе лабораторного исследования выполняется определение чувствительности возбудителя к бактериофагам, что позволяет врачу назначить адекватную терапию.

Показания к исследованию:

• Подозрение на нарушение микрофлоры кишечника;
• Подбор антибактериальной терапии;
• Оценка эффективности антибактериальной терапии.

При микробиологическом исследовании кала на дисбактериоз выдается количественная оценка всех выделенных микроорганизмов в единицах измерения КОЕ/грамм с указанием референсных значений для каждого микроорганизма и результатами оценки чувствительности к фагам.

Исследование на дисбактериоз кишечника с определением чувствительности к бактериофагам включает в себя определение следующих микроорганизмов:

Интерпретация проводится врачом с учетом клинических проявлений.

Обращаем Ваше внимание на то, что интерпретация результатов исследований, установление диагноза, а также назначение лечения, в соответствии с Федеральным законом № 323-ФЗ «Об основах охраны здоровья граждан в Российской Федерации» от 21 ноября 2011 года, должны производиться врачом соответствующей специализации.